穆氏出自子姓，以谥号为姓。据《元和姓纂》，唐虞之际，伯契教民有功，受封于商，赐姓子氏。迨武王克商，建立周朝，封商纣王庶兄微子启于宋，传十四世至宋公和，乃宋宣公之弟，继承兄位，在位九年，死前将爵位仍传给宣公之子夷，让自己的儿子离开宋国到郑国居住。为褒奖其品德，死后谥号为“穆”。其后代子孙遂有以穆为姓者。
穆氏在古代虽较少见，但也不乏名人。战国时鲁国人穆生，与楚元王交好，同学诗于浮邱伯，元王封他为中大夫，有“秉礼守道”之称。唐贞元间有穆宁者，学明经，负气节，官至殿中侍御，生四子：穆赞、穆质、穆员、穆赏，皆有贤名，人誉之“珍味”。穆宁修撰“家令”，以教育儿辈，时人称“家法以穆门为最”。宋代又有郓州人穆修，字伯长，受《易》于学者种放，大中祥符年间赐进士出身，官泰州司理参军、颍州、蔡州文学参军，善古文，著有《穆参军集》。一时士大夫言能文者，必日穆参军。在泉州，明代有穆斌、穆贤、穆留住、穆黼、穆麟、穆鸾、穆洪、穆止敬，世袭为泉州中千户所正千户。
穆姓先前聚族于河南郡(汉置，相当于今河南省洛阳市一带)，后子孙蕃衍，迁居各处，故其堂号特书“河南”；亦有书“深远”者，则取之朱熹所注：“穆穆，深远之意也”。
晋江穆氏由来颇早。唐贞元间，穆宁长子穆赞来泉州任刺史，以德政著名，得民爱戴，遂建居于泉。厥后子孙或散居龙湖亭，或分派永宁卫、泉州城郊花园头、永春、德化、延平、沙县、浯屿、大营、后深坑等地。历经沧桑，至今晋江穆氏仅有聚居深沪山头一支8户数十人。
据《温陵晋邑沪江山头穆氏族谱》所载，元顺帝时，有穆仲义与母由龙湖亭移居深沪山头，是为沪江穆氏开基之祖。“五传而为志高公，生三子，长育成，分居永春州内；次世恩，其子孙先移居安平，后仍归沪山头，俗呼北厝者是也；三宪山，生滨潮、滨洋二公，是为七世矣。滨潮公生二子，长孟耀，分居菜宅厅；次孟辉，分居垵仔顶厅。至十一世君轩公又从垵仔顶分一支居西井仔。”在明代，深沪穆氏一支颇有发展。后来却因“明清鼎革，倭寇兵燹，人民播迁流离”。及至清康熙间复界，迁回深沪的穆氏十一世族人还不上十人。余者大部分定居于永春。深沪一地濒临大海，缺乏耕地，穆氏族人多从事渔、商，也有习儒业者，但是不多。如谱记十世有穆振鹭者，“虽生长海滨而立志不凡，酷嗜书香”，于清顺治丁酉岁(1657)入泉郡府学庠生。后因迁界徙永春湖洋，病死于客地。从事渔、商者，除少数人“白手成家，积稍裕”外，多系艰难谋生，且因大海上风波莫测，常遭失事。例如：谱记十三世弘来“溺海卒”；弘见“葬浙江台州凤尾山”；弘灯“行舟没海，用魂竿灰葬本山塚”；弘法“因往捕鱼，与子元盈仝日遇风溺没”。十四世有元荫、元助“兄弟俱是溺水卒”；元杂“少年被虎鲨所伤”；元夸“没于外洋”；元南“没于浙江，长途无回”；元竹 “公往北卒”；元众“公在浙江捕鱼遭风殁”；元秋“公起冬(冬季往浙江捕带鱼)无回”；元盈“与父往北山捕鱼遇风仝日没”；元癸 “溺上海江殁”。十五世有再碧“殁于海，生卒未详”；再糍“与子世谋往北捕鱼，仝日没，葬处未详”；再螺“殁于海”；再员“舟在洋被盗所害”；再店“遇风失事”；再溪“殁于海，墓用魂竿灰与次弟再炉、四弟再赞合葬”；再谤“未娶，往捕鱼身故”；再望“行舟卒于宁波，葬小白山”；再领“行舟卒大实岛”……穆氏家族人丁本来不多，加上一次次海难损失，更是雪上加霜。
穆氏往台湾谋生的也不少。族谱载：十二世成珪“葬台湾彰化县本县庄”。十四世元春月“中年外出淡水……数十年杳无音信”。元非，“子二：再派、再窕(一名如)，俱往台湾”。十五世再传“殁于台湾，葬在台郡南路下篮仔边。”十六世世忱，“卒于台湾，墓葬在台郡南路呵公店”。深沪在清代置航船往台湾经商的甚多。穆氏也有往台湾贸易起家的。如十四世元缔(1835— 1894)，一名元爱，字淑良，“……比长有经营四方之志，游浙粤，历风波，不辞劳顿。尤善营谋，废居候时，逐什一之利。得以白手起家。”十六世世湖，字缢塘，“少家贫，十数岁便知贸易，后为人佣赁，更尽效劳之职。越数年东渡，备尝甘苦，役役焉半世风尘，厥后蓄有赢余。”
难得的是，往台经商有成的穆氏族人，秉承“仁、孝”的传统观念，致力于修族谱、建祖厝，敦宗睦族的大事。十四世穆元缔经商台浙，获有薄利，叹惜旧有世系谱牒毁于倭寇兵燹，以修谱为念，遂亲往泉城双门前、北门外、花园头及永春、延平府、沙县、浯屿、大营、后深坑等地查访穆氏族系，果然从永春迁往沙县的族人处访得旧谱，带回核查，方知始祖世系。又冒风栉雨，遍觅祖茔，一年间访得龙湖亭山始祖墓及玉坂山、永春、德化、南安潘山、福船山南坡坡、塔仔埔、华表山、许家巷诸祖茔，并从新拾骸迁葬。乃于同治十三年(1874)请里人吴启芳为纂修穆氏谱牒。
《温陵晋邑沪江山头穆氏族谱》内容丰富，除一般谱牒收入的谱序、凡例、宗支图、叙世录等篇目外，还收录了合约、厝契、阄书、批文等不同历史时期的文件资料。而且每一部分的记述具体细详，例如《穆氏修谱凡例》计列一十九条，包括：修谱体例、取名避讳、子弟教育、男女婚嫁、子孙继承、春冬祭祀、祖茔保护、祀业书券、谱牒收藏、祖厅保护、族人庆吊、世代字行、谱牒续编等，举凡族中男女，从生到死，与宗族有关的活动都有所规范。
沪江山头穆氏当时有祖厅数座，分别为：北厝祖厅、垵仔顶祖厅、菜宅祖厅、菜宅隔邻南畔插脊祖厅、西井仔祖厅、新间祖厅，穆元缔“诸祖厅一切修理粉饰，并修葺祖龛祧主，安葬、填枋奉祀等事，焕然一新。”、并规定：“祖厅中今既祧主填枋，务必订设每年轮流直东，每日洒扫清净，朝夕焚香燃烛，如遇朔望日期，更加虔心恪敬。”“祖厅中严禁不准安置床榻及釜灶、杂物、秽器，狎亵祖先。如有违规故犯，闻众斥革议罚。”穆氏祖厅编有楹联： “派溯湖亭裔，堂名礼德家。”“堂开礼德诒孙子；系出湖亭溯本源。”“家世溯龙湖，千年孙子追深远；门庭开凤里，五彩羽毛展翼谋。”“由龙湖而萃沪江，祖德宗功深且远；原菜宅以分犀井，孙贤子孝炽而昌。”
穆氏族中原本自八世以下订有字行：“孟国邦士成弘元，再世振家传孝贤。”修谱之际更增编十四字：“惟念子孙光祖德，谦恭笃敬永绵延。”
穆元缔的后人亦继承其家风。元缔次子再庚，“丁酉岁 (1897)东渡，越腊月，街衢失火漫延，四处焚烧，附近六十余家，时火廹隔邻，而君之内人吴氏与其弟妇蔡氏，一则收谱而逃；一则抱主而避。家庭之细物任人争夺弗顾也。未几火熄，而君之屋舍依然。傍人莫不称颂日：穆家有此哲妇，宜乎灾祸之不侵也!” 继元缔之后有十六世穆世湖也住台湾，“少而穷困，沐风栉雨，日谋三餐之急；长而遨游，乘风破浪，迹寄万里之遥……缔叔营为数载，费资弗继，间有一二祖宁未曾修葺者，而翁辄慨然自任，而所为重修之费，亦不下数百余金。今翁适丁父艰由东旋梓，念其缔叔已杳而谱犹未合订，诚恐迟之……爰是延师再录，增修合成。”留给后人一部内容广泛，富有特色的族谱。 沪江山头穆氏现在还保存着菜宅祖厅，并重加修葺，为三开
深沪穆氏粟宅祖厅间两榉头、石墙瓦顶的建筑。厅前木板墙皆施油漆，门联书：“族聚弦歌里；派传深远家。”横披：“龙湖著绩”。上挂“泉州刺史”横匾。厅内摆着案桌和神龛。厅柱上也书写着长联：“龙湖旧家传，开菜宅，萃j安顶，居北厝，堂堂丕振宗深远；沪江新气象，望菰峰，聚山头，分西井，世世恢宏兆永春。”
深沪穆氏在台湾鹿港有一支传裔，前几年曾通过香港报纸刊登寻根启事，深沪旅港吴先生把这一讯息带回深沪，由穆氏族老穆朝宗先生与台湾的族亲彰化县“立法委员”穆明珠通话联系。穆老先生特意把他珍藏的族谱影印一份寄给台湾的族亲，他盼望在不久的将来能与久违的亲人见面，共同祭拜穆氏的祖先。