尽管两岸清明有着很多相似的习俗，但台湾岛内清明也有些不一样的地方。
漳州籍闽南人不过清明
台湾并非每个族群都过清明节，比如祖籍漳州的闽南人，就不过清明节。相传，当年郑成功起兵“反清复明”，厌恶清明节的“清”在“明”前面，于是下令废除清明节，改三月初三“上巳日”为扫墓日。
另外，客家人从元宵节过后便开始祭祖，日期由每家自定，一直到清明为止。
扫墓之外的习俗
台湾过去有“清明不回厝无祖”的说法，这足见岛内民众对这个节日的重视程度。台湾几乎每次清明节都可放假3—4天。
台湾过清明的习俗和闽南虽然差不多，但也有一些不同，除了传统的“挂纸”和扫墓外，台湾在清明节期间还有踏青、斗鸡、插柳、拔河、荡秋千、赐火等活动。
清明节差点被废除
有两三千年历史的清明节，前些年在台湾竟差点被废除。2007年4月，当时岛内掀起新一波“去中国化”浪潮，民进党中常会通过决议，建议废除清明节的法定假期，改立《自由时代》创办人郑南榕自焚的4月7日为台湾的“言论自由日”，并要求时任“行政院长”的苏贞昌尽快办理。消息既出，引发蓝营以及广大民众的强烈反弹，民进党的阴谋最终没能得逞。
亦是蒋介石的忌日
清明节这天，也是蒋介石的忌日。
时光进入1975年，患上肺炎和心脏病的蒋介石，病情一日重似一日。到了4月5日，蒋经国早上来看望时，蒋介石的情况似乎有了好转，并露出久违的笑容。但晚上病情开始恶化，心脏出现衰竭。虽经抢救，还是于23时50分停止呼吸，终没能度过清明的夜晚。因此在台湾，清明也是“蒋公纪念日”，台当局后来将其列为法定节日，放假一天。每当清明前后，国民党高层前往大溪慈湖谒蒋陵，成为雷打不动的任务。
