海淡水交会的曾文溪口湿地，孕育数百种鱼虾贝类，生态资源十分丰富，也因此吸引众多鸟类在此觅食，是亚洲东岸到澳洲的沿海候鸟迁徒中继站。根据统计，在这里过冬的候鸟、留鸟或过境鸟多达200多种，包含雁鸭科、鹭科、鸥科、鹬鸻科等，为数惊人。其中，濒临绝种的黑面琵鹭，每年都有三分之二以上的数量会飞抵曾文溪口过冬，使得曾文溪口成为国际间备受瞩目的重要湿地，在保育团体多方争取下划定黑面琵鹭保护区，将此地列为台湾十大国际级赏鸟胜地。
黑面琵鹭于每年5、6月在北国繁殖，10月间南飞避寒，其中有一半以上在台湾渡冬，直到隔年4月间才陆续飞离，栖息时间长达7个月。在台南县市沿海湿地都曾看到黑面琵鹭的踪影，但以曾文溪口北岸聚集量多，成为国际瞩目的栖息地。黑面琵鹭属于朱鹭科，身体全长约74公分，外型像白鹭鸶，嘴部黑色，呈扁平状是重要特征。其中曾文溪口的观察记录曾高达400余只，是全世界最大的渡冬栖息地，所以特别珍贵。黑面琵鹭性喜群居，喜欢栖息在河口、海湾等大面积湿地，通常在黄昏外出时觅食，清晨才返回栖息地休息。它们会集体在水域中围成半圆形，一边前进，一边以扁平的嘴筛食鱼虾等水中生物，提高觅食效率。天寒时还会互相依偎取暖，休息时也轮流担任警戒，在众多鸟类中，具有高度社会性特质。
