两岸企业家峰会最早是在2008年9月在南京成立，开始由南京市台办主办，后来由国台办和江苏省台办共同主办。
为推动两岸企业家搭建一个更好的对话交流、合作共赢的平台，2012年，在南京举办的两岸企业家紫金山峰会上，两岸企业家共同倡议设立理事会，成立产业合作推进小组，从而深化加强两岸的产业合作。
今年2月底，曾培炎理事长应萧万长理事长邀请，率领紫金山峰会代表团赴台访问，与台湾政界高层、工商企业界领袖等各界人士进行广泛交流，听取建立两岸企业家峰会长效机制建设的想法和建议。两位理事长经过充分讨论协商，达成了在两岸分别注册成立两岸企业家峰会社团组织以及在南京和台北分别成立秘书处、设立产业合作推进小组等一系列共识。
至此，两岸企业家峰会筹组工作正式启动。
